染色体外环状DNA数据库(eccDNAdb)是线性染色体附近高度精确的环状DNA知识数据库。 EccDNA在人类和其他各种真核细胞中广泛发现,可能是由于基因组不稳定和DNA修复机制而形成的。
经过人工审查834篇文献,并仔细研究了SRA,GEO和ENA数据库的数据,eccDNAdb目前包含1,750,158个eccDNA,涉及4类,包括智人,小家鼠,鸡胆和酿酒酵母。
该数据库被组织为以一致的方式提供有关eccDNA和解释的信息。在eccDNAdb中,我们还提供了针对所有数据进行浏览,搜索和下载的工具,以及在线BLAST服务。
令人惊讶的是,新兴证据表明eccDNA在包括肿瘤发生在内的多种疾病中均起着重要作用。它可能是宝贵的资源,可帮助阐明eccDNA在疾病发展和预后中的作用,并为将eccDNA纳入未来的临床试验提供进一步的支持。